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浮游菌检测基本和尘埃颗粒检测同期进行，空气中绝大多细菌直径0.5～5μm，霉菌直径2～30μm，在空中附着在尘埃上，形成一定粒径的生物性粒子而悬浮，直接影响微生物实验室空气环境。
浮游菌采样量和采样点：
浮游菌测定时，其采样点位置可以与悬浮粒子测定点的布置相同。测点距离地面0.8~1.5m,送风口测点位置距送风面30cm左右。
浮游菌*小采样量：5级和高于5级 1000L，6级 300L，7级 200个，8级 100L，9级 100L
当洁净室很高，预期含菌浓度可能很低时，采样量应大于*小采样量很多，减少计数误差。
采样之前不得对室内空气进行熏蒸，喷洒之类的消毒。
要对测定仪器，培养皿，采样器等进行消毒灭菌，如可使用75%酒精擦拭消毒。
采样者应穿与洁净室等级相应的洁净服，放入或调换培养皿前，双手要用消毒剂消毒。
仪器消毒后放入培养皿前，先开动真空泵抽气，使仪器中的残存消毒剂蒸发，时间不小于5min。
分为空气采样和压缩空气采样。
空气采样：置采样口于采样点，依次开启采样器，如FKC-1,只需设定采样流量100L(常规）或其它采样量，即可完成自动采样。
压缩空气采样：连接压缩空气采集器，采样之前对压缩空气进行吹扫，时间不小于5min
连接好压缩空气采集器口和FKC-1采样器采样口（因FKC-1在未开启之前，不需要担心被空气中气体污染）通过空气采集器出来的气体流速高于采样速度，一直处在正压状态，空气中气体不会倒流到采样器中。
采样2个小时之内将采样器中的培养皿放入培养箱。
培养箱在放入培养之前需预热消毒30分钟以上。
至于33℃中培养箱中培养48个小时（注意湿度保持）。
浮游菌计数：
对培养后的菌落计数时，应采用5-10倍放大镜查看，若有2个或更多的菌落重叠，分辨时以2个或多个菌落计数。
如单点浓度过高，可作为坏点去除。
数出数量后*10 然后做平均，按平均值进行判断级别。
洁净室微生物动态标准
A级 浮游菌CFU/m3 ＜1
B级 10
C级 100
D级 200
检测标准参考：
1.GB/T 16294-2010《医药工业洁净室（区）沉降菌的测试方法》
2.GB 50333-2013 《医院洁净手术部建筑技术规范》
3.GB 50073-2013《洁净厂房设计规范》
4.GB/T 25915.1-2010《洁净室及相关受控环境 第1部分：空气洁净度等级》
5.GB 50687-2011《食品工业洁净用房建筑技术规范》
6.GB 50472-2008《电子工业洁净厂房设计规范》
7.GB 50457-2008《医药工业洁净厂房设计规范》
8. YY 0033-2000《无菌医疗器具生产管理规范》
9.《药品生产质量管理规范（2010年修订）》附录1
10.《医疗器械生产质量管理规范无菌医疗器械实施细则和检查评定标准（试行）》以上的洁净室微生物检测参考标准
